Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer1Q9CQL2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms