Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms