Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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