Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp3Q9CQ10 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms