Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc18Q9CQ07 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms