Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg3Q9CPX6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms