Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ5

Cenpq, Centromere protein Q, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpqQ9CPQ5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CenpqQ9CPQ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpqQ9CPQ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms