Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe41Q99PV5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms