Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf8Q99PV0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms