Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup155Q99P88 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms