Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtn4Q99P72 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms