Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sf3b1Q99NB9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms