Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acss1Q99NB1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms