Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6dQ99N07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms