Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms