Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprtQ99M80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
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