Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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