Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp16Q99LG0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp16Q99LG0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp16Q99LG0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms