Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RtcbQ99LF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RtcbQ99LF4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms