Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q99KU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q99KU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q99KU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q99KU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q99KU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q99KU6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q99KU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q99KU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q99KU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99KU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99KU6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q99KU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q99KU6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q99KU6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms