Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Reep3Q99KK1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Reep3Q99KK1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms