Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms