Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pls3Q99K51 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pls3Q99K51 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pls3Q99K51 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pls3Q99K51 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms