Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlcd1Q99JT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlcd1Q99JT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms