Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnip2Q99JG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnip2Q99JG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms