Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu1Q99J10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctu1Q99J10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms