Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf112Q96DY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf112Q96DY5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms