Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc8b1Q925Q3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc8b1Q925Q3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms