Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PdgfdQ925I7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdgfdQ925I7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms