Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmo1Q924W9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Lmo1Q924W9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lmo1Q924W9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lmo1Q924W9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lmo1Q924W9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo1Q924W9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms