Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf3Q922U1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf3Q922U1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf3Q922U1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms