Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf3Q920N1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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