Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med28Q920D3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms