Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Afg3l1Q920A7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Afg3l1Q920A7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Afg3l1Q920A7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Afg3l1Q920A7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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