Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx18Q91ZR2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms