Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Pde6cQ91ZQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde6cQ91ZQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde6cQ91ZQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Pde6cQ91ZQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde6cQ91ZQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Pde6cQ91ZQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pde6cQ91ZQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Pde6cQ91ZQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Pde6cQ91ZQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde6cQ91ZQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Pde6cQ91ZQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Pde6cQ91ZQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde6cQ91ZQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Pde6cQ91ZQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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