Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp7Q91Z40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp7Q91Z40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms