Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdhb12Q91Y07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdhb12Q91Y07 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdhb12Q91Y07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms