Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdhga12Q91XY7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcdhga12Q91XY7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcdhga12Q91XY7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdhga12Q91XY7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms