Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usb1Q91W78 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms