Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itm2cQ91VK4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itm2cQ91VK4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2cQ91VK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2cQ91VK4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2cQ91VK4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itm2cQ91VK4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms