Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H1fooQ8VIK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H1fooQ8VIK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms