Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mark1Q8VHJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mark1Q8VHJ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms