Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SnrkQ8VDU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms