Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh10Q8VCH7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh10Q8VCH7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh10Q8VCH7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms