Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rufy2Q8R4C2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy2Q8R4C2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy2Q8R4C2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms