Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim29Q8R2Q0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms