Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw1Q8K4P8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hecw1Q8K4P8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms