Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh16f2Q8K3M1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh16f2Q8K3M1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms