Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf39Q8K2Z2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf39Q8K2Z2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms